Buts des stages
Le but de ces deux stages est de donner une introduction approfondie et pratique à la gestion (Niveau 1) et l’analyse (Niveau 2) de données de baguage d’oiseaux avec des méthodes simples, disponibles dans Excel. Le stage de niveau 1 portera sur la gestion de données : tri, filtre, synthèses et représentations graphiques automatisées à l’aide de tableaux croisés dynamiques, et transformations de données à l’aide de fonctions. L’objectif est de vous fournir des outils vous permettant de vérifier vos données, produire des bilans chiffrés, et préparer les données pour des analyses statistiques (cf. niveau 2). Le stage de niveau 2 portera sur l’analyse statistique des données. Nous traiterons des méthodes de test de différence de proportions entre des échantillons (p. ex. âge-ratio, taux de retour), de test de différence de moyenne (p. ex. biométrie, indice de condition corporelle, indice de mue, indice de productivité entre sites), et d’analyse de relations entre variables par régression linéaire (p. ex. relation masse - longueur d’aile, masse - date).
En fonction de vos attentes, vous pouvez choisir de ne participer qu’à l’un des deux stages (niveau 1 ou 2), ou aux deux. Les activités au cours du stage seront de 3 types :
- cours ‘théoriques’ pour donner les concepts minimums nécessaires pour comprendre, par type d’analyse, comment collecter et organiser les données, les conditions d’application des tests, la mise en pratique sous Excel, et l’interprétation des résultats ;
- mise en application des méthodes sur des jeux de données mis à la disposition des participants (Travaux ‘Dirigés’) ;
- mise en application sur les données des participants (Travaux ‘Pratiques’). Dans le cadre de ce stage, nous n’aborderons pas les analyses statistiques de capture-marquage-recapture (p. ex. estimation d’effectif, de survie locale). Ces analyses sont l’objet du stage de niveau 3. Des stages précédents, il est ressorti qu’il est préférable de suivre le niveau 1&2 avant le niveau 3, sauf pour les personnes ayant eu des cours de statistique (p. ex. à l’université).
Organisation
Coordinateur et intervenant : Pierre-Yves HENRY (henry@mnhn.fr, 06 71 73 57 75, 01 60 47 92 28)
Intervenant : Olivier DEHORTER (dehorter@mnhn.fr, 01 40 79 30 83)
Logistique et accueil des participants : Laurent DUFRESNE (reserve@basedeloisirs78.fr, 01 30 16 44 40, 06 12 61 27 76), Maison de la réserve naturelle, base de loisirs de Saint-Quentin-en-Yvelines.
L’Observatoire Scientifique de l’Avifaune d’Île-de-France est honoré de la présence des collègues qui vont participer à cette formation. Ils seront accueillis dans un cadre particulier, celui d’une réserve naturelle nationale située en périphérie parisienne. La Réserve occupe en partie, un site historique, dépendant du Domaine National de Versailles. L’OSA et la RNN vous souhaitent un excellent séjour.
Matériel fourni :
- powerpoints des présentations et polycopiés imprimés ;
- jeux de données pour exercices (mais il vaut mieux amener les vôtres) ;
- salle équipée pour 20 personnes (tables, chaises, écran, vidéo projecteur, WiFi).
- cafetière.
Matériel à apporter :
- un ordinateur par personne avec Excel (version 2003 ou plus récent), et les logiciels R et R-Studio installés ;
- une rallonge, une multiprise, du matériel de prise de note ;
- des données que vous souhaitez analyser ;
- produits régionaux, diaporamas et/ou films pour les soirées !
Logiciels à installer sur vos ordinateurs avant le stage (nécessaires pour le niveau 2 - analyses statistiques de données ; si vous avez des problèmes d’installation, contactez Pierre-Yves dès que possible ; n’attendez pas le stage) :
- logiciel R : vous trouverez un tutoriel en français expliquant comment installer R sur cette page : http://maths.cnam.fr/IMG/pdf/R1_installationder.pdf. Le téléchargement du fichier d’installation se fait sur http://cran.r-project.org/bin/windows/base/ ou, en français, sur 01net ;
- logiciel RStudio : le téléchargement se fait sur http://www.rstudio.com/.
Programme
| Jour 1 | NIVEAU 1 – GESTION DE DONNEES | |
|---|---|---|
| 10:30-11:00 | Libre | Présentations, introduction sur fonctionnement du stage |
| 11:00-12:00 | Cours et TD | Gestion de données par tri et filtre |
| 14:00-16:00 | Cours et TD | Gestion de données par tableau croisé dynamique |
| 16:00-17:30 | TP | Problématiques des participants : application aux jeux de données des participants |
| Jour 2 | ||
| 9:00-11:00 | TP | Problématiques des participants (suite) |
| 11:00-12:30 | Cours et TD | Gestion de données avec des fonctions : principes et applications possibles |
| 14:00-17:30 | TP | Problématiques des participants. Préparation de jeux de données pour analyses de proportions, moyennes et régression linéaire |
| Jour 3 | NIVEAU 2 – ANALYSES DE DONNEES | |
| 09:00-10:30 | Cours et TD | Analyses statistiques classiques. Inclue la présentation des principes statistiques nécessaires et des outils disponibles (test d’hypothèses ; interprétation de tests statistiques, ajustement d’un modèle à des données, fonctions sous excel) |
| 10:45-11:00 | Cours et TD | Comparaison de proportions |
| 11:00-12:00 | TP | Problématiques des participants : analyse de jeux de données impliquant des comparaisons de proportions |
| 14:00-14:30 | Cours et TD | Comparaison de moyennes |
| 14:30-17:00 | TP | Problématiques des participants : analyse de jeux de données impliquant des comparaisons de moyennes |
| Jour 4 | ||
| 09:00-10:00 | Cours et TD | Corrélation et régression linéaire |
| 10:00-12:00 | TP | Problématiques des participants. Analyse de jeux de données impliquant des corrélations |
| 13:30-16:00 | TP | Problématiques des participants (suite) |
| 16:00-17:00 | Libre | Foire aux questions, évaluation et départs |
Agenda
Deux stages de 2 jours consécutifs : le samedi 7 et dimanche 8 mars 2015 (Niveau 1) et lundi 9 et mardi 10 mars 2015 (Niveau 2).
Lieu du stage
Stage : Base de loisirs de Saint-Quentin-en-Yvelines, maison de la réserve naturelle de SQY, Rond Point Eric Tabarly, RD912, 78190 Trappes. Tél : 01 30 16 44 40.
E-mail : reserve@basedeloisirs78.fr
Modes d’accès :
- En voiture : Localiser avec Mappy ou ViaMichelin
- En train : la gare de Saint-Quentin-en-Yvelines via le bus 463, arrêt Base de loisirs / Golf.
Hébergement et restauration
Logement et restauration sur place : 104,70 € par personne du samedi diner au mardi déjeuner en pension complète (nuitée + pdj + deux repas ; tarif forfait pour 20 personnes), repas du samedi midi à la charge du participant.
reserve@basedeloisirs78.fr centralise les réservations.
Participants
Nombre limité à 20 personnes, incluant bagueurs, aide-bagueurs et personnes impliquées dans l’analyse des données de baguage d’oiseaux. Ce quota sera respecté strictement (dans l’intérêt des participants), ainsi les locaux souhaitant participer sont priés de s’inscrire rapidement.
Frais du stage
Frais de stage : aucun, financé par le CRBPO.
Frais de location de salle : mise à disposition par la Réserve Naturelle Nationale de Saint-Quentin-en-Yvelines.
Frais de logement, transport et restauration : à la charge des participants.
Prise en compte comme formation
Ce stage peut être déclaré comme une formation auprès de votre employeur car il est dispensé par du personnel enseignant-chercheur du Muséum National d’Histoire Naturelle (organisme agréé à dispenser des formations par le Ministère du Travail sous le numéro 1175P009775).
