Niv. 1 - Gestion et exploration de données avec Excel
Le but de ce stage est de donner une introduction approfondie et pratique à la de données de baguage d’oiseaux avec des méthodes simples, disponibles dans Excel. Le stage porte sur la gestion de données : tri, filtre, synthèses et représentations graphiques automatisées à l’aide de tableaux croisés dynamiques, et transformations de données à l’aide de fonctions. L’objectif est de vous fournir des outils vous permettant de vérifier vos données, produire des bilans chiffrés, et préparer les données pour des analyses statistiques
Lien vers les supports de cours du niveau 1 ici.
Niv. 2 - Analyses statistiques de base avec R
Ce stage porte sur l’analyse statistique des données. Nous traiterons des méthodes de test de différence de proportions entre des échantillons (p. ex. âge-ratio, taux de retour), de test de différence de moyenne (p. ex. biométrie, indice de condition corporelle, indice de mue, indice de productivité entre sites), et d’analyse de relations entre variables par régression linéaire (p. ex. relation masse - longueur d’aile, masse - date).
Lien vers les supports de cours du niveau 2 ici.
Logiciels à installer :
- logiciel R : vous trouverez un tutoriel en français expliquant comment installer R sur cette page : http://maths.cnam.fr/IMG/pdf/R1_installationder.pdf. Le téléchargement du fichier d’installation se fait sur http://cran.r-project.org/bin/windows/base/ ou, en français, sur 01net ;
- logiciel RStudio : le téléchargement se fait sur [https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/] ;
- pour les utilisateurs Mac, pensez à installer un VirtualOffice (ou équivalent) et Excel.
Niv. 3 - Analyses statistiques de capture-marquage-recapture avec MARK
Ce stage fournit une introduction approfondie et pratique aux bagueurs aux analyses statistiques de données de Capture-Marquage-Recapture, c’est-à-dire l’analyse des données de « Capture / Non-capture » d’individus au cours du temps.
Les buts des analyses statistiques abordées sont :
- l’estimation et l’analyse des variations du nombre d’individus présents sur un site à une période donnée (cf. taille de population) ;
- l’estimation et l’analyse des variations du taux de survie sur un site (cf. probabilité de survie locale).
Lien vers les supports de cours du niveau 3 ici.
Logiciels à installer (Attention : disponible seulement pour Windows. Si vous avez un Mac, vous devez absolument installer Virtual PC sur votre ordinateur, sinon vous ne pourrez pas faire les applications sur vos données.) :
- MARK, à télécharger sur : _ http://welcome.warnercnr.colostate.edu/ gwhite/mark/mark.htm#Downloading ‘New Version …’. Pour les problèmes d’installation sous Vista et Mac, voir : http://warnercnr.colostate.edu/ gwhite/mark/mark.htm#Downloading
- U-CARE, à télécharger en deux étapes : (1) installer LIBRARIES (STEP 1), puis (2) installer U-CARE. Les fichiers d’installation sont disponibles sur : http://www.cefe.cnrs.fr/fr/recherche/bc/bbp/1045-desc/264-logiciels.
Si U-Care ne se lance pas sur Vista, désinstaller les Libraries et U-Care 2.3, et installer les version 7.2 des deux paquets (cf. forum de U-Care : http://www.phidot.org/forum/viewtopic.php?t=820&highlight=vista).
Si cela vous donne le message d’erreur suivant : ’MCRInstaller_M_7_17_x64.exe is not a valid Win32 application’ (alors que ça ne semble pas logique...), récupérez les librairies MATLAB adaptée directement sur le site de MATLAB, en prenant bien la version qui correspond aux librairies de compilation de la version de U-Care que vous allez installer. P.ex. si il est indiqué U-CARE version MCR 7.17, prenez la librairie R1202a (7.17). Pour plus d’info sur cette solution, voir le forum U-Care. - CLOSE-TEST, à télécharger sur http://www.fort.usgs.gov/Products/Software/Clostest/. NB1 : Pour ceux fonctionnant avec Windows 7, le fichier d’installation est à télécharger sur https://www.cloud.sfr.fr/?shareObject=c971a3a9-5ec2-e856-6e0c-6d57d0d09d99. NB2 : les versions 32 bit de logiciels fonctionnent (normalement) sur des machines 64, MAIS pas l’inverse. Attention, si on utilise une version 32, toutes les librairies doivent être 32.
- TEXTPAD, à télécharger sur http://www.01net.com/telecharger/windows/Bureautique/editeur_de_texte/fiches/3689.html